Хаплогрупа D-M55

Од Википедија — слободната енциклопедија
Хаплогрупа D-M55
Можно време на потекло45,357 (95% CI 52,258 - 39,364) години пред сегашноста[1]

45,200 (95% CI 48,500 <-> 42,000) години пред сегашноста[2]
Возраст на спојување21,434 (95% CI 24,812 - 18,513) години пред сегашноста[3]

21,000 (95% CI 22,800 <-> 19,300) години пред сегашноста[2]
Можно место на потеклоЈапонски архипелаг
ПредокD-M174
Дефинирање на мутацииM55, M57, M64.1, M179, P37.1, P41.1, P190, 12f2b
Највисоки фреквенцииЈапонци, Џомони, Ајни、 Рукуанци

Хаплогрупата D-M55 (M64.1/Page44.1) позната и како Хаплогрупа D1a2a — хаплогрупа со Y хромозом. Таа е една од двете гранки на Хаплогрупата D1a. Другата е D1a1, која се среќава со висока фреквенција кај Тибеќаните и другите тибето-бурмански популации и географски блиски групи. D е исто така распространета со мала до средна фреквенција во Централна Азија, Источна Азија и континентална Југоисточна Азија.

Хаплогрупата D-M55 се наоѓа кај околу 33% [4] [5] [6] [7] [8]од денешните јапонски мажи. Била пронајдена во четиринаесет од примерокот од шеснаесет или 87,5% од примерокот кај мажите Ајни во едно иследување објавено во 2004 година [9] и во три од примерок од четири или 75% од примерокот кај мажите Ајни во друго проучување објавено во 2005 година во која некои поединци од студијата од 2004 година можеби биле повторно тестирани. Во моментов таа е најчестата Y-ДНК хаплогрупа во Јапонија доколку O1-F265 и O2-M122 (Најновиот заеднички предок (НЗП) приближно 30.000 ~ 35.000 п.с.) се сметаат за посебни хаплогрупи. Хаплогрупата D-M55 можеби е родена во Јапонија во секое време помеѓу нејзината НЗП со D-Y34637 (најдена во денешни Онги и Јарави) пред околу 45.000 години и НЗП на сите постоечки гранки на D-M55 пред околу 21.000 години.

Во 2017 година било потврдено дека јапонската гранка на хаплогрупата D-M55 е различна и изолирана од другите гранки на хаплогрупата D од пред околу 50.000 години. Расцепот во Д1а можеби се случил во близина на Тибетската Висорамнина. [10]

Историја[уреди | уреди извор]

Патека на миграција на хаплогрупата Д
Миграциски пат на хаплогрупите Y-ДНК во Источна Азија

Меѓу подгрупите на Хаплогрупата D, предокот на D-М55 отишол на исток за да стигне до јапонскиот архипелаг. [11] Според Мајкл Ф. Хамер од Универзитетот во Аризона, хаплогрупата D настанала во близина на Тибетската Висорамнина и мигрирала во Јапонија кога на крајот станала D-M55. [12] Мицуру Сакитани рекол дека Хаплогрупата D1 дошла од Тибет до северниот дел на Кјушу преку Алтајските Планини и Корејскиот Полуостров, а Хаплогрупата D-М55 (D1а2а) била родена во јапонскиот архипелаг.

Неодамнешните проучувања сугерираат дека D-M55 станала доминантен за време на доцниот период на Џомоните, непосредно пред доаѓањето на Јајоите, што укажува на популационен бум и пад. [13]

Фреквенција[уреди | уреди извор]

Просечната фреквенција на Јапонци е околу 33%. [14] Високите фреквенции се наоѓаат на различни места во Јапонија, особено во Хокаидо, источен Хоншу, јужен Кјушу и Окинава.

Античка ДНК[уреди | уреди извор]

Човек од народот Џомон бил ископан од остатоците од Фунадомари (околу 3.800 - 3.500 п.с.) на островот Ребун во Хокаидо. Тој припаѓа на хаплогрупата D1a2a2a (D-CTS220). [22]

Анализата на примерокот Џомон (Икавазу) и древен примерок од Тибетската Висорамнина (Чохопани, Ch) открила само делумно заедничко потекло, што укажува на позитивно генетско тесно грло во врска со ширењето на хаплогрупата од античка популација поврзана со примерокот од тибетските Чокопани ( и современи тибето-бурмански групи). [23]

Филогенетско дрво[уреди | уреди извор]

Со дрво ISOGG (Верзија: 14.151). [24]

Наводи[уреди | уреди извор]

  1. ↑ „Welcome to FamilyTreeDNA Discover“.
  2. ↑ 2,0 2,1 YFull Haplogroup YTree v7.02.01 as of March 15, 2019.
  3. ↑ „Welcome to FamilyTreeDNA Discover“.
  4. ↑ Hammer, Michael F.; Karafet, Tatiana M.; Park, Hwayong; Omoto, Keiichi; Harihara, Shinji; Stoneking, Mark; Horai, Satoshi (2006). „Dual origins of the Japanese: Common ground for hunter-gatherer and farmer Y chromosomes“. Journal of Human Genetics. 51 (1): 47–58. doi:10.1007/s10038-005-0322-0. PMID 16328082.
  5. ↑ YOUICHI SATO, TOSHIKATSU SHINKA, ASHRAF A. EWIS, AIKO YAMAUCHI, TERUAKI IWAMOTO, YUTAKA NAKAHORI Overview of genetic variation in the Y chromosome of modern Japanese males.
  6. ↑ Nonaka, I.; Minaguchi, K.; Takezaki, N. (February 2, 2007). „Y-chromosomal Binary Haplogroups in the Japanese Population and their Relationship to 16 Y-STR Polymorphisms“. Annals of Human Genetics. 71 (Pt 4): 480–95. doi:10.1111/j.1469-1809.2006.00343.x. PMID 17274803. |hdl-access= бара |hdl= (help)
  7. ↑ „Overview of genetic variation in the Y chromosome of modern Japanese males“. Anthropological Science. 122 (3): 131–136. 2014. doi:10.1537/ase.140709.
  8. ↑ Katoh, Toru; Munkhbat, Batmunkh; Tounai, Kenichi; и др. (2005). „Genetic features of Mongolian ethnic groups revealed by Y-chromosomal analysis“. Gene. 346: 63–70. doi:10.1016/j.gene.2004.10.023. PMID 15716011.
  9. ↑ 9,0 9,1 Tajima, Atsushi; и др. (2004). „"(March 2, 2004). "Genetic origins of the Ainu inferred from combined DNA analyses of maternal and paternal lineages“. Journal of Human Genetics. 49 (4): 187–193. doi:10.1007/s10038-004-0131-x. PMID 14997363.
  10. ↑ Mondal, Mayukh & Bergström, Anders & Xue, Yali & Calafell, Francesc & Laayouni, Hafid & Casals, Ferran & Majumder, Partha & Tyler-Smith, Chris & Bertranpetit, Jaume.
  11. ↑ 崎谷満『DNA・考古・言語の学際研究が示す新・日本列島史』（勉誠出版　2009年）(in Japanese)
  12. ↑ „Archived copy“ (PDF). Архивирано од изворникот (PDF) на 2009-03-04. Посетено на 2017-09-29.CS1-одржување: архивиран примерок како наслов (link)
  13. ↑ Ohashi, Jun; Tokunaga, Katsushi; Hitomi, Yuki; Sawai, Hiromi; Khor, Seik-Soon; Naka, Izumi; Watanabe, Yusuke (2019-06-17). „Analysis of whole Y-chromosome sequences reveals the Japanese population history in the Jomon period“. Scientific Reports (англиски). 9 (1): 8556. Bibcode:2019NatSR...9.8556W. doi:10.1038/s41598-019-44473-z. ISSN 2045-2322. PMC 6572846. PMID 31209235.
  14. ↑ Katoh, Toru; Munkhbat, Batmunkh; Tounai, Kenichi; и др. (2005). „Genetic features of Mongolian ethnic groups revealed by Y-chromosomal analysis“. Gene. 346: 63–70. doi:10.1016/j.gene.2004.10.023. PMID 15716011.
  15. ↑ „Assignment of Y-chromosomal SNPs found in Japanese population to Y-chromosomal haplogroup tree“. Journal of Human Genetics. 58 (4): 195–201. April 2013. doi:10.1038/jhg.2012.159. PMID 23389242.
  16. ↑ Shinka, Toshikatsu; Tomita, Keiko; Toda, Tatsushi; Kotliarova, Svetlana E.; Lee, Juwon; Kuroki, Yoko; Jin, Dong Kyu; Tokunaga, Katsushi; Nakamura, Hideki (1999). „Genetic variations on the y chromosome in the Japanese population and implications for modern human y chromosome lineage“. Journal of Human Genetics. 44 (4): 240–245. doi:10.1007/s100380050151. PMID 10429363.
  17. ↑ Totsuka, Shoji; Sato, Youichi; Tanaka, Masashi (2016). „A study of the geographic distribution of y chromosomal and mitochondrial DNA haplogroups in Japanese population by Super Science High School Consortium (SSH)“. Anthropological Science (Japanese Series). 124 (2): 85–91. doi:10.1537/asj.161018.
  18. ↑ 18,0 18,1 Hirofumi Nohara, Ikuko Maeda, Rinnosuke Hisazumi, Taketo Uchiyama, Hiroko Hirashima, Masahito Nakata, Rika Ohno, Tetsuro Hasegawa, and Kenshi Shimizu (2021), "Geographic distribution of Y-STR haplotypes and Y-haplogroups among Miyazaki Prefecture residents." Japanese Journal of Forensic Science and Technology, Vol.
  19. ↑ Y Seo, Y Takami, T Nakayama, and K Takahama, "Y chromosome DNA polymorphisms and their haplotypes in a Japanese population." Leg Med (Tokyo) 1999 Sep;1(3):145-9.
  20. ↑ Kim, Soon-Hee; Kim, Ki-Cheol; Shin, Dong-Jik; Jin, Han-Jun; Kwak, Kyoung-Don; Han, Myun-Soo; Song, Joon-Myong; Kim, Won; Kim, Wook (2011). „High frequencies of Y-chromosome haplogroup O2b-SRY465 lineages in Korea: a genetic perspective on the peopling of Korea“. Investigative Genetics. 2011 (2): 10. doi:10.1186/2041-2223-2-10. PMC 3087676. PMID 21463511.
  21. ↑ Tumonggor, Meryanne K; Karafet, Tatiana M; Downey, Sean; и др. (2014). „Isolation, contact and social behavior shaped genetic diversity in West Timor“. Journal of Human Genetics. 59 (9): 494–503. doi:10.1038/jhg.2014.62. PMC 4521296. PMID 25078354.
  22. ↑ 神澤ほか(2016)「礼文島船泊縄文人の核ゲノム解析」第70回日本人類学大会 (in Japanese)
  23. ↑ Boer, Elisabeth de; Yang, Melinda A.; Kawagoe, Aileen; Barnes, Gina L. (2020). „Japan considered from the hypothesis of farmer/language spread“. Evolutionary Human Sciences (англиски). 2: e13. doi:10.1017/ehs.2020.7. ISSN 2513-843X. PMC 10427481 Проверете ја вредноста |pmc= (help). PMID 37588377 Проверете ја вредноста |pmid= (help).
  24. ↑ „2019-2020 Haplogroup D Tree“.
  25. ↑ „Genetic affinities of the Andaman Islanders, a vanishing human population“. Current Biology. 13 (2): 86–93. January 2003. doi:10.1016/S0960-9822(02)01336-2. PMID 12546781.
  26. ↑ „D YTree“. Архивирано од изворникот на 2019-08-31. Посетено на 2019-09-02.
  27. ↑ Y-DNA Haplogroup D and its Subclades - 2014
  28. ↑ Tyler-Smith, Chris; Xue, Yali; Thomas, Mark G.; Yang, Huanming; Arciero, Elena; Asan; Connell, Bruce A.; Jones, Abigail L.; Haber, Marc (2019-06-13). „A Rare Deep-Rooting D0 African Y-Chromosomal Haplogroup and Its Implications for the Expansion of Modern Humans out of Africa“. Genetics (англиски). 212 (4): 1421–1428. doi:10.1534/genetics.119.302368. ISSN 0016-6731. PMC 6707464. PMID 31196864.
  29. ↑ Estes, Roberta (2019-06-21). „Exciting New Y DNA Haplogroup D Discoveries!“. DNAeXplained - Genetic Genealogy (англиски). Посетено на 2019-07-08.
Филогенетско дрво на човечките ДНК хаплогрупи на човечкиот Y-хромозом [χ 1][χ 2]
"Y-хромозомски Адам"
A00 A0-T [χ 3]
A0 A1 [χ 4]
A1a A1b
A1b1 BT
B CT
DE CF
D E C F
F1  F2  F3  GHIJK
G HIJK
IJK H
IJ K
I   J     LT [χ 5]       K2 [χ 6]
L     T    K2a [χ 7]        K2b [χ 8]     K2c     K2d K2e [χ 9]  
K-M2313 [χ 10]     K2b1 [χ 11] P [χ 12]
NO1   S [χ 13]  M [χ 14]    P1     P2
N O Q R
Footnotes
  1. ↑ Van Oven M, Van Geystelen A, Kayser M, Decorte R, Larmuseau HD (2014). „Seeing the wood for the trees: a minimal reference phylogeny for the human Y chromosome“. Human Mutation. 35 (2): 187–91. doi:10.1002/humu.22468. PMID 24166809. S2CID 23291764.
  2. ↑ International Society of Genetic Genealogy (ISOGG; 2015), Y-ДНК Хаплогрупа Tree 2015. (Access date: 1 February 2015.)
  3. ↑ Хаплогрупа A0-T е исто позната како A-L1085 (и претходно како A0'1'2'3'4).
  4. ↑ Хаплогрупа A1 е исто така позната и како A1'2'3'4.
  5. ↑ Хаплогрупа LT (L298/P326) е исто така позната и како Хаплогрупа K1.
  6. ↑ Помеѓу 2002 и 2008, Хаплогрупа T-M184 била позната како "Хаплогрупа K2". Оттогаш тоа име е повторно доделено на K-M526, брат или сестра на Хаплогрупа LT.
  7. ↑ Хаплогрупа K2a (M2308) и нејзината примарна подклада K-M2313 биле одделени од Хаплогрупа NO (F549) во 2016 година. (Ова следеше по објавувањето на: Poznik GD, Xue Y, Mendez FL, и др. (2016). „Punctuated bursts in human male demography inferred from 1,244 worldwide Y-chromosome sequences“. Nature Genetics. 48 (6): 593–9. doi:10.1038/ng.3559. PMC 4884158. PMID 27111036. Во минатото, друга Хаплогрупа, NO (M214) и K2e исто така се идентификувале како "K2a".
  8. ↑ Хаплогрупа K2b (M1221/P331/PF5911) е исто така позната и како Хаплогрупа MPS.
  9. ↑ Хаплогрупа K2e (K-M147) претходно била позната како "Хаплогрупа X" и "K2a" (но е брат/сестра подклада на сегашната K2a).
  10. ↑ K-M2313*, кој сè уште нема филогенетско име, е документиран кај две живи индивидуи, кои имаат етнички врски со Индија и Југоисточна Азија. Покрај тоа, K-Y28299, кој се чини дека е примарна гранка на K-M2313, е пронајден кај три живи индивидуи од Индија. Види
    Poznik op. cit.; YFull YTree v5.08, 2017, "K-M2335", and; PhyloTree, 2017, "Details of the Y-SNP markers included in the minimal Y tree" (Датум на пристап на овие страници: 9 декември 2017 година)
  11. ↑ Хаплогрупа K2b1 (P397/P399) е исто така позната и како Хаплогрупа MS, но има поширока и посложена внатрешна структура.
  12. ↑ Хаплогрупа P (P295) is also klnown as K2b2.
  13. ↑ Хаплогрупа S, од of 2017, е исто така позната и како K2b1a. (Претходно името Хаплогрупа S било доделено на K2b1a4.)
  14. ↑ Хаплогрупа M, од 2017, е исто така позната и како K2b1b. (Претходно името Хаплогрупа M било доделено на K2b1d.)
Преземено од „https://mk.wikipedia.org/w/index.php?title=Хаплогрупа_D-M55&oldid=5168920“