Хаплогрупа E-V38

Од Википедија — слободната енциклопедија
Хаплогрупа E-V38 (порано E3a / E1b1a)
Можно време на потекло41,400 п.н.е.[1]
Возраст на спојување39,200 п.н.е.[1]
Можно место на потеклоИсточна Африка[2][3]
ПредокE-P2
ПотомциE-M2, E-M329
Дефинирање на мутацииL222.1, V38, V100

Хаплогрупата E-V38, позната и како E1b1a-V38 — хаплогрупа на ДНК на човечки Y-хромозом. E-V38 е првенствено дистрибуиран во суб-сахарска Африка. E-V38 има две базални гранки, E-M329 и E-M2.[2] E-M329 е подклада која најчесто се наоѓа во Источна Африка. [2] Е-М2 е доминантна подклада во Западна Африка, Централна Африка, Јужна Африка и регионот на африканските Големи езера; исто така се јавува на умерени фреквенции во некои делови од Северна Африка, Западна Азија и Јужна Европа.

Потекло[уреди | уреди извор]

Откривањето на два SNP (V38 и V100) од Тромбета и сор. (2011) значително го редефинираа филогенетското дрво E-V38. Ова ги наведе авторите да сугерираат дека E-V38 можеби потекнува од Источна Африка. V38 се придружува на E-M2 поврзана со Западна Африка и E-M329 поврзана со североисточна Африка со претходен заеднички предок кој, како и E-P2, можеби исто така потекнува од Источна Африка.[4] Низводното SNP E-M180 можеби потекнува од влажната јужноцентрална Сахарска савана/пасина во Северна Африка помеѓу 14.000 п.н.е. и 10.000 п.н.е.[5][6][7][8] Според Вуд и сор. (2005) и Роза и сор. (2007), ваквите движења на населението ја променија постоечката популација Y хромозомска разновидност во Централна, Јужна и Југоисточна Африка, заменувајќи ги претходните фреквенции на хаплогрупите (хаплогрупите А и Б-М60) во овие области со сега доминантните E1b1a1 лоза. Трагите од претходните жители, сепак, може да се забележат денес во овие региони преку присуството на Y DNA хаплогрупите A1a, A1b, A2, A3 и B-M60 кои се вообичаени кај одредени популации, како што се Мбути и Коисан.[9][10][11] Шринер и сор. (2018) на сличен начин сугерира дека хаплогрупата E1b1a-V38 мигрирала низ Зелената Сахара од исток кон запад пред околу 19.000 години, каде што E1b1a1-M2 последователно може да потекнува од Западна Африка или Централна Африка. Шринер и сор. (2018) исто така ја следи оваа миграција преку мутација на српеста клетка, која најверојатно потекнува од периодот на Зелената Сахара.

Античка ДНК[уреди | уреди извор]

Гад и сор. (2021) укажува дека древните египетски мумии на Рамзес III и Непознатиот човек Е, веројатно Пентаур, ја носеле хаплогрупата E1b1a.[12]

Во Кабечо да Амореира, во Португалија, еден поробен западноафриканец, кој можеби бил од сенегамбискиот крајбрежен регион Гамбија, Мавританија или Сенегал, и носел хаплогрупи E1b1a и L3b1a, бил закопан меѓу школки во средината на 16 век и н.е. 18 век од нашата ера.[13]

Распространетост[уреди | уреди извор]

Фреквенцијата и разновидноста на E-V38 се највисоки во Западна Африка. Во Африка, E-V38 прикажува клиничка дистрибуција од запад кон исток, како и од југ кон север. Со други зборови, фреквенцијата на хаплогрупата се намалува како што се движи од западна и јужна Африка кон источните и северните делови на Африка.[14]

Подклади[уреди | уреди извор]

Е-М2[уреди | уреди извор]

E1b1a1 е дефиниран со маркери DYS271/M2/SY81, M291, P1/PN1, P189, P293, V43 и V95. E-M2 е разновидна хаплогрупа со многу гранки.

Е-М329[уреди | уреди извор]

E1b1a2 е дефиниран со SNP мутацијата M329. E-M329 најчесто се наоѓа во Источна Африка.[15] E-M329 е исто така чест во југозападна Етиопија, особено кај популациите што зборуваат омотски.[16][17]

Филогенетика[уреди | уреди извор]

Филогенетска историја[уреди | уреди извор]

Пред 2002 година, во академската литература имаше најмалку седум системи за именување на филогенетското дрво на Y-хромозомот. Ова доведе до значителна конфузија. Во 2002 година, главните истражувачки групи се собраа и го формираа конзорциумот на Y-хромозомот (YCC). Тие објавија заеднички труд кој создаде единствено ново дрво кое сите се согласија да го користат. Подоцна, група граѓански научници со интерес за популациската генетика и генетската генеалогија формираа работна група за да се создаде аматерско дрво со цел да биде пред сè навремено. Табелата подолу ги обединува сите овие дела на местото на обележјето на YCC дрвото од 2002 година. Ова му овозможува на истражувачот што прегледува постара објавена литература брзо да се движи помеѓу номенклатурите.

YCC 2002/2008 (α) (β) (γ) (δ) (ε) (ζ) (η) YCC 2002 YCC 2005 YCC 2008 YCC 2010r ISOGG 2006 ISOGG 2007 ISOGG 2008 ISOGG 2009 ISOGG 2010 ISOGG 2011 ISOGG 2012
E-P29 21 III 3A 13 Eu3 H2 B E* E E E E E E E E E E
E-M33 21 III 3A 13 Eu3 H2 B E1* E1 E1a E1a E1 E1 E1a E1a E1a E1a E1a
E-M44 21 III 3A 13 Eu3 H2 B E1a E1a E1a1 E1a1 E1a E1a E1a1 E1a1 E1a1 E1a1 E1a1
E-M75 21 III 3A 13 Eu3 H2 B E2a E2 E2 E2 E2 E2 E2 E2 E2 E2 E2
E-M54 21 III 3A 13 Eu3 H2 B E2b E2b E2b E2b1 - - - - - - -
E-P2 25 III 4 14 Eu3 H2 B E3* E3 E1b E1b1 E3 E3 E1b1 E1b1 E1b1 E1b1 E1b1
E-M2 8 III 5 15 Eu2 H2 B E3a* E3a E1b1 E1b1a E3a E3a E1b1a E1b1a E1b1a E1b1a1 E1b1a1
E-M58 8 III 5 15 Eu2 H2 B E3a1 E3a1 E1b1a1 E1b1a1 E3a1 E3a1 E1b1a1 E1b1a1 E1b1a1 E1b1a1a1a E1b1a1a1a
E-M116.2 8 III 5 15 Eu2 H2 B E3a2 E3a2 E1b1a2 E1b1a2 E3a2 E3a2 E1b1a2 E1b1a2 E1ba12 - -
E-M149 8 III 5 15 Eu2 H2 B E3a3 E3a3 E1b1a3 E1b1a3 E3a3 E3a3 E1b1a3 E1b1a3 E1b1a3 E1b1a1a1c E1b1a1a1c
E-M154 8 III 5 15 Eu2 H2 B E3a4 E3a4 E1b1a4 E1b1a4 E3a4 E3a4 E1b1a4 E1b1a4 E1b1a4 E1b1a1a1g1c E1b1a1a1g1c
E-M155 8 III 5 15 Eu2 H2 B E3a5 E3a5 E1b1a5 E1b1a5 E3a5 E3a5 E1b1a5 E1b1a5 E1b1a5 E1b1a1a1d E1b1a1a1d
E-M10 8 III 5 15 Eu2 H2 B E3a6 E3a6 E1b1a6 E1b1a6 E3a6 E3a6 E1b1a6 E1b1a6 E1b1a6 E1b1a1a1e E1b1a1a1e
E-M35 25 III 4 14 Eu4 H2 B E3b* E3b E1b1b1 E1b1b1 E3b1 E3b1 E1b1b1 E1b1b1 E1b1b1 - -
E-M78 25 III 4 14 Eu4 H2 B E3b1* E3b1 E1b1b1a E1b1b1a1 E3b1a E3b1a E1b1b1a E1b1b1a E1b1b1a E1b1b1a1 E1b1b1a1
E-M148 25 III 4 14 Eu4 H2 B E3b1a E3b1a E1b1b1a3a E1b1b1a1c1 E3b1a3a E3b1a3a E1b1b1a3a E1b1b1a3a E1b1b1a3a E1b1b1a1c1 E1b1b1a1c1
E-M81 25 III 4 14 Eu4 H2 B E3b2* E3b2 E1b1b1b E1b1b1b1 E3b1b E3b1b E1b1b1b E1b1b1b E1b1b1b E1b1b1b1 E1b1b1b1a
E-M107 25 III 4 14 Eu4 H2 B E3b2a E3b2a E1b1b1b1 E1b1b1b1a E3b1b1 E3b1b1 E1b1b1b1 E1b1b1b1 E1b1b1b1 E1b1b1b1a E1b1b1b1a1
E-M165 25 III 4 14 Eu4 H2 B E3b2b E3b2b E1b1b1b2 E1b1b1b1b1 E3b1b2 E3b1b2 E1b1b1b2a E1b1b1b2a E1b1b1b2a E1b1b1b2a E1b1b1b1a2a
E-M123 25 III 4 14 Eu4 H2 B E3b3* E3b3 E1b1b1c E1b1b1c E3b1c E3b1c E1b1b1c E1b1b1c E1b1b1c E1b1b1c E1b1b1b2a
E-M34 25 III 4 14 Eu4 H2 B E3b3a* E3b3a E1b1b1c1 E1b1b1c1 E3b1c1 E3b1c1 E1b1b1c1 E1b1b1c1 E1b1b1c1 E1b1b1c1 E1b1b1b2a1
E-M136 25 III 4 14 Eu4 H2 B E3ba1 E3b3a1 E1b1b1c1a E1b1b1c1a1 E3b1c1a E3b1c1a E1b1b1c1a1 E1b1b1c1a1 E1b1b1c1a1 E1b1b1c1a1 E1b1b1b2a1a1

Истражувачки публикации[уреди | уреди извор]

Следниве истражувачки тимови по нивните публикации беа претставени во креирањето на дрвото на YCC.

Филогенетски дрвја[уреди | уреди извор]

Ова филогенетско стебло на подкладите на хаплогрупите се заснова на стеблото на Y-хромозомот (YCC).[18][19]

  • E1b1a (L222.1, V38, V100)
    • E1b1a1 (DYS271/M2/SY81, M291, P1/PN1, P189, P293, V43, V95, Z1101, Z1107, Z1116, Z1120, Z1122, Z1123, Z1125, Z113, Z125, Z11)
    • E1b1a2 (M329)

Наводи[уреди | уреди извор]

  1. ↑ 1,0 1,1 „E-V38 YTree“.
  2. ↑ 2,0 2,1 2,2 Trombetta, Beniamino; Fulvio Cruciani; Daniele Sellitto; Rosaria Scozzari (6 January 2011). MacAulay, Vincent (уред.). „A New Topology of the Human Y Chromosome Haplogroup E1b1 (E-P2) Revealed through the Use of Newly Characterized Binary Polymorphisms“. PLOS ONE. 6 (1): e16073. Bibcode:2011PLoSO...616073T. doi:10.1371/journal.pone.0016073. PMC 3017091. PMID 21253605.
  3. ↑ Shriner, Daniel; Rotimi, Charles (2018). „Whole-Genome-Sequence-Based Haplotypes Reveal Single Origin of the Sickle Allele during the Holocene Wet Phase“. American Journal of Human Genetics. Am J Hum Genet. 102 (4): 547–556. doi:10.1016/j.ajhg.2018.02.003. PMC 5985360. PMID 29526279.
  4. ↑ Trombetta, Beniamino; Fulvio Cruciani; Daniele Sellitto; Rosaria Scozzari (6 January 2011). MacAulay, Vincent (уред.). „A New Topology of the Human Y Chromosome Haplogroup E1b1 (E-P2) Revealed through the Use of Newly Characterized Binary Polymorphisms“. PLOS ONE. 6 (1): e16073. Bibcode:2011PLoSO...616073T. doi:10.1371/journal.pone.0016073. PMC 3017091. PMID 21253605.
  5. ↑ „E-V43 YTree“.
  6. ↑ International Society of Genetic Genealogy (3 February 2010). „Y-DNA Haplogroup E and its Subclades – 2010“. Посетено на 17 December 2010.
  7. ↑ Adams, Jonathan. „Africa During the Last 150,000 Years“. Архивирано од изворникот на 1 May 2006. Посетено на 26 January 2011.
  8. ↑ Montano, Valeria; Gianmarco Ferri; Veronica Marcari; Chiara Batini; Okorie Anyaele; Giovanni Destro-Bisol; David Comas (1 July 2011). „The Bantu expansion revisited a new analysis of Y chromosome variation in Central Western Africa“. Molecular Ecology. 20 (13): 2693–2708. doi:10.1111/j.1365-294X.2011.05130.x. PMID 21627702.
  9. ↑ Rosa, Alexandra; Carolina Ornelas; Mark A Jobling; António Brehm; Richard Villems (27 July 2007). „Y-chromosomal diversity in the population of Guinea-Bissau: a multiethnic perspective“. BMC Evolutionary Biology. 7: 124. doi:10.1186/1471-2148-7-124. PMC 1976131. PMID 17662131.
  10. ↑ Wood, Elizabeth T; Daryn A Stover, Christopher Ehret, Giovanni Destro-Bisol, Gabriella Spedini, Howard McLeod, Leslie Louie, Mike Bamshad, Beverly I Strassmann, Himla Soodyall and Michael F Hammer (27 Apr 2005). „Contrasting patterns of Y chromosome and mtDNA variation in Africa: evidence for sex-biased demographic processes“. European Journal of Human Genetics. 13 (7): 867–876. doi:10.1038/sj.ejhg.5201408. PMID 15856073.CS1-одржување: повеќе имиња: список на автори (link)
  11. ↑ Underhill, P.A; Passarino G, Lin AA, Shen P, Mirazón Lahr M, Foley RA, Oefner PJ, Cavalli-Sforza LL. (Jan 2001). „The phylogeography of Y chromosome binary haplotypes and the origins of modern human populations“. Annals of Human Genetics. 65 (1): 43–62. doi:10.1046/j.1469-1809.2001.6510043.x. PMID 11415522.CS1-одржување: повеќе имиња: список на автори (link)
  12. ↑ Gad, Yehia Z; и др. (2021). „Insights from ancient DNA analysis of Egyptian human mummies: clues to disease and kinship“. Human Molecular Genetics. 30 (R1): R24–R28. doi:10.1093/hmg/ddaa223. ISSN 0964-6906. OCLC 8681412353. PMID 33059357 Проверете ја вредноста |pmid= (help).
  13. ↑ Peyroteo-Stjerna, Rita; и др. (21 February 2022). „Multidisciplinary investigation reveals an individual of West African origin buried in a Portuguese Mesolithic shell midden four centuries ago“. Journal of Archaeological Science: Reports. 42: 103370. doi:10.1016/j.jasrep.2022.103370. OCLC 1337974923.
  14. ↑ Luis, J.R.; D.J.Rowold (March 2004). „The Levant versus the Horn of Africa: Evidence for Bidirectional Corridors of Human Migrations“. The American Journal of Human Genetics. 74 (3): 532–544. doi:10.1086/382286. PMC 1182266. PMID 14973781.
  15. ↑ Trombetta, Beniamino; Fulvio Cruciani; Daniele Sellitto; Rosaria Scozzari (6 January 2011). MacAulay, Vincent (уред.). „A New Topology of the Human Y Chromosome Haplogroup E1b1 (E-P2) Revealed through the Use of Newly Characterized Binary Polymorphisms“. PLOS ONE. 6 (1): e16073. Bibcode:2011PLoSO...616073T. doi:10.1371/journal.pone.0016073. PMC 3017091. PMID 21253605.
  16. ↑ Plaster et al. Y-DNA E subclades
  17. ↑ C.A., Plaster (2011-09-28). „Variation in Y chromosome, mitochondrial DNA and labels of identity on Ethiopia“. discovery.ucl.ac.uk. Посетено на 2018-06-27.
  18. ↑ Karafet, Tatiana M.; Fernando L. Mendez; Monica B. Meilerman; Peter A. Underhill; Stephen L. Zegura; Michael F. Hammer (May 2008). „New binary polymorphisms reshape and increase resolution of the human Y chromosomal haplogroup tree“. Genome Research. 18 (5): 830–838. doi:10.1101/gr.7172008. PMC 2336805. PMID 18385274.
  19. ↑ International Society of Genetic Genealogy (3 February 2010). „Y-DNA Haplogroup E and its Subclades – 2010“. Посетено на 17 December 2010.

Извори за табели за конверзија[уреди | уреди извор]

Надворешни врски[уреди | уреди извор]

Филогенетско дрво на човечките ДНК хаплогрупи на човечкиот Y-хромозом [χ 1][χ 2]
"Y-хромозомски Адам"
A00 A0-T [χ 3]
A0 A1 [χ 4]
A1a A1b
A1b1 BT
B CT
DE CF
D E C F
F1  F2  F3  GHIJK
G HIJK
IJK H
IJ K
I   J     LT [χ 5]       K2 [χ 6]
L     T    K2a [χ 7]        K2b [χ 8]     K2c     K2d K2e [χ 9]  
K-M2313 [χ 10]     K2b1 [χ 11] P [χ 12]
NO1   S [χ 13]  M [χ 14]    P1     P2
N O Q R
Footnotes
  1. ↑ Van Oven M, Van Geystelen A, Kayser M, Decorte R, Larmuseau HD (2014). „Seeing the wood for the trees: a minimal reference phylogeny for the human Y chromosome“. Human Mutation. 35 (2): 187–91. doi:10.1002/humu.22468. PMID 24166809. S2CID 23291764.
  2. ↑ International Society of Genetic Genealogy (ISOGG; 2015), Y-ДНК Хаплогрупа Tree 2015. (Access date: 1 February 2015.)
  3. ↑ Хаплогрупа A0-T е исто позната како A-L1085 (и претходно како A0'1'2'3'4).
  4. ↑ Хаплогрупа A1 е исто така позната и како A1'2'3'4.
  5. ↑ Хаплогрупа LT (L298/P326) е исто така позната и како Хаплогрупа K1.
  6. ↑ Помеѓу 2002 и 2008, Хаплогрупа T-M184 била позната како "Хаплогрупа K2". Оттогаш тоа име е повторно доделено на K-M526, брат или сестра на Хаплогрупа LT.
  7. ↑ Хаплогрупа K2a (M2308) и нејзината примарна подклада K-M2313 биле одделени од Хаплогрупа NO (F549) во 2016 година. (Ова следеше по објавувањето на: Poznik GD, Xue Y, Mendez FL, и др. (2016). „Punctuated bursts in human male demography inferred from 1,244 worldwide Y-chromosome sequences“. Nature Genetics. 48 (6): 593–9. doi:10.1038/ng.3559. PMC 4884158. PMID 27111036. Во минатото, друга Хаплогрупа, NO (M214) и K2e исто така се идентификувале како "K2a".
  8. ↑ Хаплогрупа K2b (M1221/P331/PF5911) е исто така позната и како Хаплогрупа MPS.
  9. ↑ Хаплогрупа K2e (K-M147) претходно била позната како "Хаплогрупа X" и "K2a" (но е брат/сестра подклада на сегашната K2a).
  10. ↑ K-M2313*, кој сè уште нема филогенетско име, е документиран кај две живи индивидуи, кои имаат етнички врски со Индија и Југоисточна Азија. Покрај тоа, K-Y28299, кој се чини дека е примарна гранка на K-M2313, е пронајден кај три живи индивидуи од Индија. Види
    Poznik op. cit.; YFull YTree v5.08, 2017, "K-M2335", and; PhyloTree, 2017, "Details of the Y-SNP markers included in the minimal Y tree" (Датум на пристап на овие страници: 9 декември 2017 година)
  11. ↑ Хаплогрупа K2b1 (P397/P399) е исто така позната и како Хаплогрупа MS, но има поширока и посложена внатрешна структура.
  12. ↑ Хаплогрупа P (P295) is also klnown as K2b2.
  13. ↑ Хаплогрупа S, од of 2017, е исто така позната и како K2b1a. (Претходно името Хаплогрупа S било доделено на K2b1a4.)
  14. ↑ Хаплогрупа M, од 2017, е исто така позната и како K2b1b. (Претходно името Хаплогрупа M било доделено на K2b1d.)
Преземено од „https://mk.wikipedia.org/w/index.php?title=Хаплогрупа_E-V38&oldid=5181231“