Хеминформатика: Разлика помеѓу преработките

[проверена преработка]

Избришана содржина Додадена содржина

Во редови

Преработка од 15:06, 23 мај 2020

Хеминформатиката, позната и како хемоинформатика или хемиска информатика (англиски термини chemoinformatics, cheminformatics, chemical informatics и chemiinformatics) по дефиниција претставува употреба на компјутерски и информатички техники за решавање на голем број на проблеми на полето на хемијата. Ваквите in slilico техники во голема мерка се користат во фармацевтските фирми во раните фази од процесот на дизајна на нови лекови. Овие методи може во голема мерка да се користат и во другите области на хемијата за решавање на хемиски проблеми од различен карактер.

Историја

Терминот хеминформатика е дефиниран од страна на F.K. Brown^[1]^[2] во 1998 година на следниот начин:

Хеминформатиката претставува употреба на изворите на информации за трансформација на податоците во информации и на информациите во знаење со намера побрзо да се добијат повеќе информации за изнаоѓање на супстанци кои би можело да се користат во при развојот на нови лекови.

Основи

Хеминформатиката во себе ги комбинира сознанијата и алатките кои се користат во хемијата и информатиката. На пример во теоријата на хемиски графови и пребарување низ хемискиот простор (се претпоставува дека хемискиот простор содржи најмалку 10⁶⁰ молекули). Дел од алгоритмите кои се користат во хеминформатиката исто така се користат и во хемометријата.

Примена

Складирање и пребарување на хемиски структури

Една од првите примени на хеминформатиката е во изнаоѓањето на постапки за складирање и пребарување на структури на хемиските супстанци. Ефективно пребарување низ структурни информации за молекулите во себе вклучува користење на информатички алатки (за пребарување низ податоци и машинско учење), како и познавања од областа на теоријата на графови (или поточно на хемиската теорија на графови). Истражувањата поврзани со претходното вклучуваат работа со:

Неструктуирани податоци
Пребарување на структуирани податоци
- Пребарувања низ бази на податоци
- Пребарувања низ хемиски графови
- Пребарувања низ молекули и др.

Формати на податотеки за складирање на хемиски структури

За in silico претставување на хемиските структури се користат специјализирани формати (пр XML, SDF, SMILES и др.). Ваквите формати за претставување на хемиски структури се користат за складирање на структурите во хемиски бази на податоци. Некои типови на формати се погодни за виртуелно претставување на дводимензионален и тридимензионални структури, додека пак, други формати се попогодни за изучување на физичките својства, за моделирање или, пак, за изучување на протеин-лиганд интеракциите.

Квантитативна структура-активност релации (КСАР)

КСАР моделите (како што уште се нарекуваат квантитативни структура–својства релации - КССР) служат за предвидување активноста на некоја супстанца (или на некое нејзино својство) врз основа на нејзината структура. Во овој КСАР моделите се тесно поврзани со хемометријата.

Слични содржини

Литература

↑ F.K. Brown (1998). „Chapter 35. Chemoinformatics: What is it and How does it Impact Drug Discovery“. Annual Reports in Med. Chem. 33: 375. doi:10.1016/S0065-7743(08)61100-8.
↑ Brown, Frank (2005). „Editorial Opinion: Chemoinformatics – a ten year update“. Current Opinion in Drug Discovery & Development. 8 (3): 296–302.

Надворешни врски

The Free On-line Cheminformatics Service
The Blue Obelisk Movement
The eCheminfo Network and Community of Practice
Cheminformatics at Indiana University
The Chemical Structure Association Trust (see also CSA Trust).
Comprehensive cheminformatics link list and data set repository
A cheminformatics glossary
Chemoinf.com Chemoinformatics Hub
Chemoinformatics initiatives at NCL Pune, India
International Conference on Chemoinformatics at NCL,Pune
Chemical Informatics Education and Research at Indiana University
Famous Cheminformatics quotations
The Cheminformatics and QSAR Society
UK-QSAR and ChemoInformatics Group
Education and Research at the University of Hamburg
Cheminformatics research at the Unilever Centre for Molecular Informatics, Cambridge, UK
YACHS Yet Another CHemistry Summarizer, Laboratoire Informatique d'Avignon LIA, France
Cheminformatics research at NovaMechanics Cyprus

Предлошка:Technology-footer

[Brown_1998-1] F.K. Brown (1998). „Chapter 35. Chemoinformatics: What is it and How does it Impact Drug Discovery“. Annual Reports in Med. Chem. 33: 375. doi:10.1016/S0065-7743(08)61100-8.

[2] Brown, Frank (2005). „Editorial Opinion: Chemoinformatics – a ten year update“. Current Opinion in Drug Discovery & Development. 8 (3): 296–302.

[1]

[2]

@@ Ред 1: / Ред 1: @@
 '''Хеминформатиката''', позната и како ''хемоинформатика'' или ''хемиска информатика'' (англиски термини ''chemoinformatics'', ''cheminformatics'', ''chemical informatics'' и ''chemiinformatics'') по дефиниција претставува употреба на компјутерски и информатички техники за решавање на голем број на проблеми на полето на хемијата. Ваквите in slilico техники во голема мерка се користат во фармацевтските фирми во раните фази од процесот на дизајна на нови лекови. Овие методи може во голема мерка да се користат и во другите области на хемијата за решавање на хемиски проблеми од различен карактер.
 == Историја ==
-Терминот хеминформатика е дефиниран од страна на F.K. Brown<ref name="Brown_1998">{{цитирано списание | author = F.K. Brown | title = Chapter 35. Chemoinformatics: What is it and How does it Impact Drug Discovery | journal = Annual Reports in Med. Chem. | year = 1998 | volume = 33 | pages = 375 | doi = 10.1016/S0065-7743(08)61100-8}}</ref><ref>{{цитирано списание | author = Brown, Frank | title = Editorial Opinion: Chemoinformatics – a ten year update | journal = [[Current Opinion in Drug Discovery & Development]]| year = 2005 | volume = 8 | issue = 3 | pages = 296–302}}</ref> во 1998 година на следниот начин:
+Терминот хеминформатика е дефиниран од страна на F.K. Brown<ref name="Brown_1998">{{наведено списание | author = F.K. Brown | title = Chapter 35. Chemoinformatics: What is it and How does it Impact Drug Discovery | journal = Annual Reports in Med. Chem. | year = 1998 | volume = 33 | pages = 375 | doi = 10.1016/S0065-7743(08)61100-8}}</ref><ref>{{наведено списание | author = Brown, Frank | title = Editorial Opinion: Chemoinformatics – a ten year update | journal = [[Current Opinion in Drug Discovery & Development]]| year = 2005 | volume = 8 | issue = 3 | pages = 296–302}}</ref> во 1998 година на следниот начин:
 <blockquote>
 Хеминформатиката претставува употреба на изворите на информации за трансформација на податоците во информации и на информациите во знаење со намера побрзо да се добијат повеќе информации за изнаоѓање на супстанци кои би можело да се користат во при развојот на нови лекови.
 </blockquote>
 == Основи ==
+Хеминформатиката во себе ги комбинира сознанијата и алатките кои се користат во хемијата и информатиката. На пример во теоријата на хемиски графови и пребарување низ хемискиот простор (се претпоставува дека хемискиот простор содржи најмалку 10<sup>60</sup> молекули). Дел од алгоритмите кои се користат во хеминформатиката исто така се користат и во [[хемометрија]]та.
-Хеминформатиката во себе ги комбинира сознанијата и алатките кои се користат во хемијата и информатиката. На пример во теоријата на хемиски графови и пребарување низ хемискиот простор (се претпоставува дека хемискиот простор содржи најмалку 10<sup>60</sup> молекули). Дел од алгоритмите кои се користат во [[хеминформатика]]та исто така се користат и во [[хемометрија]]та.
 == Примена ==
@@ Ред 65: / Ред 62: @@
 * [http://www-ucc.ch.cam.ac.uk/ Cheminformatics research at the Unilever Centre for Molecular Informatics, Cambridge, UK]
 * [http://daniel.iut.univ-metz.fr/yachs YACHS Yet Another CHemistry Summarizer, Laboratoire Informatique d'Avignon LIA, France]
 * [http://www.novamechanics.com/ Cheminformatics research at NovaMechanics Cyprus]
 {{Technology-footer}}
 {{Нормативна контрола}}
 [[Категорија:Хеминформатика| ]]
 [[Категорија:Хемија]]