Хаплогрупа L1

Хаплогрупа L1
Можно време на потекло	107,600–174,300 п.н.е.
Можно место на потекло	Централна Африка
Предок	L1-6
Потомци	L1b, L1c
Дефинирање на мутации	3666, 7055, 7389, 13789, 14178, 14560

Хаплогрупа L1 — човечка митохондријална ДНК (mДНК) хаплогрупа. Најчест е во Централна Африка и Западна Африка. Се оддалечил од L1-6 пред околу 140.000 години (140,6+33,7
33,0 140,6+33,7
33,0 95% CI).^[3] Нејзиното појавување е поврзано со раното населување на Африка од анатомски модерни луѓе за време на Еемијата, а сега најмногу се наоѓа кај африканските пигми.

Распространетост[уреди | уреди извор]

Хаплогрупата L1 се наоѓа најчесто во Централна Африка и Западна Африка. Ја достигнува својата најголема фреквенција меѓу пигмеите Мбенга. Многу е веројатно дека порано бил пораспространет и бил ограничен на неговата сегашна област како резултат на миграцијата на Банту (која во голема мера е поврзана со хаплогрупата L2).^[4] Хаплогрупата L1 е забележана во примероци од островските гробишта во Кулубнарти, Судан, кои датираат од ранохристијанскиот период (550–800 година од н.е.).^[5] Античка Бикерова култура на индивидуа во Камино де лас Јесерас во Шпанија (Сан Фернандо де Хенарес, Мадрид;

Филогенија[уреди | уреди извор]

L1 има две гранки, L1c и L1b (порано именуваните хаплогрупи L1d, L1k, L1a, L1f биле рекласифицирана во хаплогрупа L0, како L0d, L0k, L0a, L0f; L1e како L5).

L1c[уреди | уреди извор]

Хаплогрупата L1c се појавила на околу 85 кв. Своите највисоки фреквенции ги достигнува во Западна и Централна Африка, особено кај народите Мбенга Пигмејците.^[6] Меѓу Мбенга, го носат 100% од Ба-Кола, 97% од Ба-Бензеле и 77% од Биака.^[7] Други популации во кои L1c е особено распространет ги вклучуваат луѓето Беџан (Тикар) (100%), луѓето Бака од Габон (97%) и Камерун (90%),^[8] Бакоја (97%) и Ба-Бонго (82%).^[6] Вообичаено, исто така, во Сао Томе (20%) и Ангола (16-24%).^[9]

Филогенија:

L1c
- L1c1'2'4'6
  - L1c1
    - L1c1a
      - L1c1a1
        L1c1a1a
        L1c1a1a1
        L1c1a1a1a
        
        L1c1a1a1b
        L1c1a1a1b1
        
        L1c1a1a2
        
        L1c1a1b
      - L1c1a2
        L1c1a2a
        L1c1a2a1
        
        L1c1a2a2
        
        L1c1a2b
        
        L1c1a2c
    - L1c1b'c'd
      - L1c1b
      - L1c1c'd
        L1c1c
        
        L1c1d
  - L1c2'4
    - L1c2
      - L1c2a
        L1c2a1
        L1c2a1a
        
        L1c2a1b
        
        L1c2a2
      - L1c2b
        L1c2b1
        
        L1c2b2
    - L1c4
      - L1c4a
      - L1c4b
  - L1c6
- L1c3
  - L1c3a
    - L1c3a1
    - L1c3a1a
  - L1c3b'c
    - L1c3b
      - L1c3b1
        L1c3b1a
        
        L1c3b1b
      - L1c3b2
    - L1c3c

L1b[уреди | уреди извор]

Хаплогрупата L1b е многу понова, датирана на околу 10 кв. Често е во Западна Африка. Пронајден е и во Мозамбик (1%), Етиопија (2%), Египет (1%), долината на Нил (4%), Кунг (1%), Кејп Верде (8%), Сенегал (17-20%) %), Нигер/Нигерија (15%), Гвинеја Бисау (11%), Мароко (4-5%) и Алжир (1-2%).^[10]

Филогенија:

L1b
- L1b1
  - L1b1a
    - L1b1a1'4
      - L1b1a1
      - L1b1a4
    - L1b1a2
      - L1b1a2a
    - 189
      - L1b1a3
        L1b1a3a
        L1b1a3a1
    - L1b1a5
    - L1b1a6
    - L1b1b7

Наводи[уреди | уреди извор]

↑ Soares, Pedro; Luca Ermini; Noel Thomson; Maru Mormina; Teresa Rito; Arne Röhl; Antonio Salas; Stephen Oppenheimer; Vincent Macaulay; Martin B. Richards (4 Jun 2009). „Supplemental Data Correcting for Purifying Selection: An Improved Human Mitochondrial Molecular Clock“. The American Journal of Human Genetics. 84 (6): 82–93. doi:10.1016/j.ajhg.2009.05.001. PMC 2694979. PMID 19500773.
↑ van Oven, Mannis; Manfred Kayser (13 Oct 2008). „Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation“. Human Mutation. 30 (2): E386–E394. doi:10.1002/humu.20921. PMID 18853457. S2CID 27566749.
↑ „Correcting for Purifying Selection: An Improved Human Mitochondrial Molecular Clock Supplementary material (p. 82)“ (PDF). 2009: 89. Архивирано од изворникот (PDF) на 2009-12-29. Наводот journal бара |journal= (help)
↑ Silva, Marina; Alshamali, Farida; Silva, Paula; Carrilho, Carla; Mandlate, Flávio; Jesus Trovoada, Maria; Černý, Viktor; Pereira, Luísa; Soares, Pedro (2015). „60,000 years of interactions between Central and Eastern Africa documented by major African mitochondrial haplogroup L2“. Sci. Rep. 5: 12526. Bibcode:2015NatSR...512526S. doi:10.1038/srep12526. PMC 4515592. PMID 26211407.
↑ Sirak, Kendra; Frenandes, Daniel; Novak, Mario; Van Gerven, Dennis; Pinhasi, Ron (2016). „Abstract Book of the IUAES Inter-Congress 2016 - A community divided? Revealing the community genome(s) of Medieval Kulubnarti using next- generation sequencing“. Abstract Book of the Iuaes Inter-Congress 2016. IUAES: 115.
↑ ^6,0 ^6,1 Quintana-Murci; и др. (2008). „Maternal traces of deep common ancestry and asymmetric gene flow between Pygmy hunter–gatherers and Bantu-speaking farmers“. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 105 (5): 1596–601. Bibcode:2008PNAS..105.1596Q. doi:10.1073/pnas.0711467105. PMC 2234190. PMID 18216239.
↑ Sarah A. Tishkoff et al. 2007, History of Click-Speaking Populations of Africa Inferred from mtDNA and Y Chromosome Genetic Variation.
↑ Lluis Quintana-Murci et al. MtDNA diversity in Central Africa: from hunter-gathering to agriculturalism.
↑ Batini, Chiara et al 2006, Phylogeography of the human mitochondrial L1c haplogroup: Genetic signatures of the prehistory of Central Africa Архивирано на 24 март 2012 г.
↑ Rosa, Alexandra; и др. (2004). „MtDNA profile of West Africa Guineans: towards a better understanding of the Senegambia region“ (PDF). Annals of Human Genetics. 68 (4): 340–52. doi:10.1046/j.1529-8817.2004.00100.x. PMID 15225159. Посетено на 5 June 2017. |hdl-access= бара |hdl= (help)

Надворешни врски[уреди | уреди извор]

PhyloTree.org - mДНК поддрво L, van Oven & Kayser M. 2009 година.
Ширење на Хаплогрупата L1, од National Geographic
Секвенците на африканската хаплогрупа L mДНК покажуваат прекршувања на еволуцијата слична на часовникот
Хаплоггрупата L1b на Иан Логан.
Хаплоггрупата L1c на Иан Логан.
L1 YFull MTree 1.02.00 (во изградба)

[Soares-1] Soares, Pedro; Luca Ermini; Noel Thomson; Maru Mormina; Teresa Rito; Arne Röhl; Antonio Salas; Stephen Oppenheimer; Vincent Macaulay; Martin B. Richards (4 Jun 2009). „Supplemental Data Correcting for Purifying Selection: An Improved Human Mitochondrial Molecular Clock“. The American Journal of Human Genetics. 84 (6): 82–93. doi:10.1016/j.ajhg.2009.05.001. PMC 2694979. PMID 19500773.

[vanOven-2] van Oven, Mannis; Manfred Kayser (13 Oct 2008). „Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation“. Human Mutation. 30 (2): E386–E394. doi:10.1002/humu.20921. PMID 18853457. S2CID 27566749.

[soares_supplementary-3] „Correcting for Purifying Selection: An Improved Human Mitochondrial Molecular Clock Supplementary material (p. 82)“ (PDF). 2009: 89. Архивирано од изворникот (PDF) на 2009-12-29. Наводот journal бара |journal= (help)

[4] Silva, Marina; Alshamali, Farida; Silva, Paula; Carrilho, Carla; Mandlate, Flávio; Jesus Trovoada, Maria; Černý, Viktor; Pereira, Luísa; Soares, Pedro (2015). „60,000 years of interactions between Central and Eastern Africa documented by major African mitochondrial haplogroup L2“. Sci. Rep. 5: 12526. Bibcode:2015NatSR...512526S. doi:10.1038/srep12526. PMC 4515592. PMID 26211407.

[5] Sirak, Kendra; Frenandes, Daniel; Novak, Mario; Van Gerven, Dennis; Pinhasi, Ron (2016). „Abstract Book of the IUAES Inter-Congress 2016 - A community divided? Revealing the community genome(s) of Medieval Kulubnarti using next- generation sequencing“. Abstract Book of the Iuaes Inter-Congress 2016. IUAES: 115.

[Quintana08-6] 6,0 ^6,1 Quintana-Murci; и др. (2008). „Maternal traces of deep common ancestry and asymmetric gene flow between Pygmy hunter–gatherers and Bantu-speaking farmers“. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 105 (5): 1596–601. Bibcode:2008PNAS..105.1596Q. doi:10.1073/pnas.0711467105. PMC 2234190. PMID 18216239.

[Tishkoff-7] Sarah A. Tishkoff et al. 2007, History of Click-Speaking Populations of Africa Inferred from mtDNA and Y Chromosome Genetic Variation.

[8] Lluis Quintana-Murci et al. MtDNA diversity in Central Africa: from hunter-gathering to agriculturalism.

[Batini-9] Batini, Chiara et al 2006, Phylogeography of the human mitochondrial L1c haplogroup: Genetic signatures of the prehistory of Central Africa Архивирано на 24 март 2012 г.

[Rosa2004-10] Rosa, Alexandra; и др. (2004). „MtDNA profile of West Africa Guineans: towards a better understanding of the Senegambia region“ (PDF). Annals of Human Genetics. 68 (4): 340–52. doi:10.1046/j.1529-8817.2004.00100.x. PMID 15225159. Посетено на 5 June 2017. |hdl-access= бара |hdl= (help)

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]