Бонифациј III (лат. Bonifatius PP. III; ? - 12 ноември607) — римски папа од 19 февруари607 до 12 ноември607[1]. Се родил во Рим, но долго време поминал во Цариград, каде што бил советник на императорот Фока. Го уредил избирањето на нов папа, така што забранил прашањето да се решава во текот на трите дена по смртта на стариот папа. Од императорот Фока добил признание во првенство на римската над останатите епархии.