ФК Беса била оформена во 1976 година.
Во пресрет на сезоната 2018/2019, Беса која била учесник во Општинската лига Гостивар, го презела клубот Чаклани кој бил третолигаш во моментот. Со тоа новата управа на Чаклани го сменила името на клубот во Беса.