Хеминформатика: Разлика помеѓу преработките
[проверена преработка] | [проверена преработка] |
с r2.7.1) (Робот: Додава war:Kimoimpormika |
с r2.7.3) (Робот: Додава he:כימואינפורמטיקה |
||
Ред 83: | Ред 83: | ||
[[fr:Chémoinformatique]] |
[[fr:Chémoinformatique]] |
||
[[it:Chemioinformatica]] |
[[it:Chemioinformatica]] |
||
[[he:כימואינפורמטיקה]] |
|||
[[ja:ケモインフォマティクス]] |
[[ja:ケモインフォマティクス]] |
||
[[pl:Informatyka chemiczna]] |
[[pl:Informatyka chemiczna]] |
Преработка од 13:40, 11 јули 2012
Хеминформатиката, позната и како хемоинформатика или хемиска информатика (англиски термини chemoinformatics, cheminformatics, chemical informatics и chemiinformatics) по дефиниција претставува употреба на компјутерски и информатички техники за решавање на голем број на проблеми на полето на хемијата. Ваквите in slilico техники во голема мерка се користат во фармацевтските фирми во раните фази од процесот на дизајна на нови лекови. Овие методи може во голема мерка да се користат и во другите области на хемијата за решавање на хемиски проблеми од различен карактер.
Историја
Терминот хеминформатика е дефиниран од страна на F.K. Brown[1][2] во 1998 година на следниот начин:
Хеминформатиката претставува употреба на изворите на информации за трансформација на податоците во информации и на информациите во знаење со намера побрзо да се добијат повеќе информации за изнаоѓање на супстанци кои би можело да се користат во при развојот на нови лекови.
Основи
Хеминформатиката во себе ги комбинира сознанијата и алатките кои се користат во хемијата и информатиката. На пример во теоријата на хемиски графови и пребарување низ хемискиот простор (се претпоставува дека хемискиот простор содржи најмалку 1060 молекули). Дел од алгоритмите кои се користат во хеминформатиката исто така се користат и во хемометријата.
Примена
Складирање и пребарување на хемиски структури
Една од првите примени на хеминформатиката е во изнаоѓањето на постапки за складирање и пребарување на структури на хемиските супстанци. Ефективно пребарување низ структурни информации за молекулите во себе вклучува користење на информатички алатки (за пребарување низ податоци и машинско учење), како и познавања од областа на теоријата на графови (или поточно на хемиската теорија на графови). Истражувањата поврзани со претходното вклучуваат работа со:
- Неструктуирани податоци
- Пребарување на структуирани податоци
- Пребарувања низ бази на податоци
- Пребарувања низ хемиски графови
- Пребарувања низ молекули и др.
Формати на податотеки за складирање на хемиски структури
За in silico претставување на хемиските структури се користат специјализирани формати (пр XML, SDF, SMILES и др.). Ваквите формати за претставување на хемиски структури се користат за складирање на структурите во хемиски бази на податоци. Некои типови на формати се погодни за виртуелно претставување на дводимензионален и тридимензионални структури, додека пак, други формати се попогодни за изучување на физичките својства, за моделирање или, пак, за изучување на протеин-лиганд интеракциите.
Квантитативна структура-активност релации (КСАР)
КСАР моделите (како што уште се нарекуваат квантитативни структура–својства релации - КССР) служат за предвидување активноста на некоја супстанца (или на некое нејзино својство) врз основа на нејзината структура. Во овој КСАР моделите се тесно поврзани со хемометријата.
Слични содржини
- Хемометрија
- Квантна хемија
- Анализа на податоци
- Протеин-лиганд интеракции
- Математичка хемија
- Молекулско моделирање
- Статистика
- Квантитативна структура-својства релации
Литература
Надворешни врски
- The Free On-line Cheminformatics Service
- The Blue Obelisk Movement
- The eCheminfo Network and Community of Practice
- Cheminformatics at Indiana University
- The Chemical Structure Association Trust (see also CSA Trust).
- Comprehensive cheminformatics link list and data set repository
- A cheminformatics glossary
- Chemoinf.com Chemoinformatics Hub
- Chemoinformatics initiatives at NCL Pune, India
- International Conference on Chemoinformatics at NCL,Pune
- Chemical Informatics Education and Research at Indiana University
- Famous Cheminformatics quotations
- The Cheminformatics and QSAR Society
- UK-QSAR and ChemoInformatics Group
- Education and Research at the University of Hamburg
- Cheminformatics research at the Unilever Centre for Molecular Informatics, Cambridge, UK
- YACHS Yet Another CHemistry Summarizer, Laboratoire Informatique d'Avignon LIA, France
- Cheminformatics research at NovaMechanics Cyprus