Jmol

Од Википедија — слободната енциклопедија
Прејди на прегледникот Прејди на пребарувањето
Jmol
J(S)mol logo 2013.svg
Jmol screenshot streptavidin.png
Тридимензионално структурно претставување на стрептавидин со Jmol
Програмери Развојна екипа на Jmol
Првично издание 2001; пред 17 години (2001)
Развојна состојба Активен
Прог. јазик Јава
Опер. систем повеќеплатформски
Подлога Системи со Јава и прелистувачи без Јава
Јазици Каталонски, кинески, чешки, дански, холандски, англиски,француски, германски, унгарски, индонезиски, италијански, корејски, португалски, шпански, турски, украински[1]
Вид Молекуларно моделирање
Лиценца LGPL 2.0
Мреж. место jmol.org

Jmol — компјутерски софтвер за молекуларно моделирање на хемиските структури во 3-димензии.[2] Jmol дава 3D претстава на молекула и може да се користи како образовна програма,[3] или пак како истражувачка програма на пр., во хемијата и биохемијата. Напишана е во програмскиот Јава, па може да работи на оперативниот систем Виндоус, Мекинтош, Линукс и Уникс, доколку на истите и инсталиран пакетот Јава. Станува збор за слободен софтвер објавен под лиценцата GNU Lesser General Public License (LGPL) верзија 2.0. Постојат самостојна апликација и развоен софтверски пакет, кои можат да бидат надоградени со други Јава апликации, како што се Биоклипс и Таверна.

Позната карактеристика на програмот е што може да биде вграден во мрежни странициза да ги прикаже молекулите на најразлични начини. На пример, молекулите може да се претставуваат како моделите топче и стап, просторен модел, јамчест дијаграм, и.т.н.[4] Jmol поддржува широк спектар на хемиски податочни формати, вклучувајќи Protein Data Bank (pdb), Crystallographic Information File (cif), MDL Molfile (mol), и Chemical Markup Language (CML). Постои исто така и самостојна верзија JavaScript во (HTML5), JSmol, која може да се користи на компјутери без Јава.[5]

Програмата Jmol, меѓу другите можности, нуди алтернатива на приклучокот Chime,[3] кој повеќе активно не се развива. Иако Jmol има многу особенсоти кои му недостасуваат на Chime, не ги содржи сите способности на, особено, модот Sculpt. Chime побарува приклучна инсталација и Интернет Експлорер 6.0 или Фајерфокс 2.0 на Микрософт Виндоус, или Нетскејп Кумуникатор 4.8 на Мекинтош 9. Jmol побарува инсталација на Јава и може да се користи на бројни оперативни системи. На пример, Jmol е целосно функционален на Фајрфокс, Интернет Експлорер, Опера, Гугл Хром и Сафари.


Снимки[уреди | уреди извор]

Поврзано[уреди | уреди извор]

Наводи[уреди | уреди извор]

  1. Jmol translations
  2. Chen, Jim X. (2008), Springer, уред., Guide to Graphics Software Tools, стр. 471, ISBN 978-1-84800-900-4 
  3. 3,0 3,1 Herráez, A (2006), "Biomolecules in the Computer: Jmol to the Rescue", Biochemistry and Molecular Biology Education 34 (4): 7, doi:10.1002/bmb.2006.494034042644 
  4. Herráez, A (2007), Lulu, уред., How to Use Jmol to Study and Present Molecular Structures, Volume 1, стр. 21, ISBN 978-1-84799-259-8 
  5. „JSmol“. http://wiki.jmol.org/index.php/JSmol. посет. 2 ноември 2015 г. 

Надворешни врски[уреди | уреди извор]