Gemmatimonadetes

Од Википедија — слободната енциклопедија
Прејди на прегледникот Прејди на пребарувањето
Gemmatimonadetes
Научна класификација
Домен: Bacteria
Колено: Gemmatimonadetes
Zhang et al. 2003
Класи
Синоними
  • Gemmatimonadaeota Oren et al. 2015

Gemmatimonadetes е колено на бактерии создадено за видот Gemmatimonas aurantiaca. Оваа Грам-негативна бактерија сочинува околу 2% од почвените бактериски заедници а коленото на кое припаѓа е идентификувано како едно од првите девет колена по застапеност во почви.[1] Gemmatimonadetes се најдени во различни суви почви, како што се тревни површини, прерии и пасишта, како и во еутрофични езерски седименти и алпски почви. Овој широк дијапазон на средини каде Gemmatimonadetes биле пронајдени сугерира дека тие се адаптирани на ниско ниво на влага во почвата.[2] Според една студија дистрибуцијата на Gemmatimonadetes во почвата има тенденција да биде повеќе зависна од достапноста на влага отколку од агрегацијата, потврдувајќи го верувањето дека членовите на ова колено преферираат посуви почви.[3] Исто така неодамна беше откриен нов вид на ова колено кој е способен за фотосинтеза[4].

Првиот член на ова колено беше откриен во 2003 година во активна мил добиена од третман на отпадни води и беше именуван Gemmatimonas aurantiaca.[5] Метаболичките патишта и ензимите на оваа бактерија се уникатни во бактерискиот свет, а таа е способна и за анаеробна и за аеробна респирација.[6]

Таксономија[уреди | уреди извор]

Моментално прифатената таксономија е базирана на List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LSPN),[7] National Center for Biotechnology Information [8] и All-Species Living Tree Project. [9]

Поврзано[уреди | уреди извор]

List of bacterial orders

Наводи[уреди | уреди извор]

  1. Fawaz, Mariam. Revealing the Ecological Role of Gemmatimonadetes Through Cultivation and Molecular Analysis of Agricultural Soils. „Master's Thesis, University of Tennessee“: vi. 
  2. DeBruyn, J; Nixon, L; Fawaz, M; Johnson, M; Radosevich, M. Global Biogeography and Quantitative Season Dynamics of Gemmatimonadetes in Soil. „Appl. Environ. Microbiol.“ том  77 (17): 6295–300. doi:10.1128/AEM.05005-11. PMID 21764958. 
  3. Fawaz, Mariam. Revealing the Ecological Role of Gemmatimonadetes Through Cultivation and Molecular Analysis of Agricultural Soils. „Master's Thesis, University of Tennessee“: vi. 
  4. Zeng, Yonghui; Selyanin, Vadim; Lukeš, Martin; Dean, Jason; Kaftan, David; Feng, Fuying; Koblížek, Michal (2015 г). Characterization of the microaerophilic, bacteriochlorophyll a-containing bacterium Gemmatimonas phototrophica sp. nov., and emended descriptions of the genus Gemmatimonas and Gemmatimonas aurantiaca. „International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology“ том  65 (8): 2410–2419. doi:10.1099/ijs.0.000272. http://ijs.microbiologyresearch.org/content/journal/ijsem/10.1099/ijs.0.000272. 
  5. Gemmatimonas aurantiaca gen. nov., sp. nov., a gram-negative, aerobic, polyphosphate-accumulating micro-organism, the first cultured representative of the new bacterial phylum Gemmatimonadetes phyl. nov.. „Int J Syst Evol Microbiol“ том  53 (Pt 4): 1155–63. doi:10.1099/ijs.0.02520-0. PMID 12892144. 
  6. Takaichi, S; Maoka, T; Takasaki, K; Hanada, S. Carotenoids of Gemmatimonas aurantiaca (Gemmatimonadetes): identification of a novel carotenoid, deoxyoscillol 2-rhamnoside, and proposed biosynthetic pathway of oscillol 2,2′-dirhamnoside. „Microbiology“ том  156 (3): 757–763. doi:10.1099/mic.0.034249-0. PMID 19959572. 
  7. J.P. Euzéby. „Gemmatimonadetes“. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). http://www.bacterio.net/-classifphyla.html#Gemmatimonadetes. посет. 20 март 2016 г. 
  8. Sayers. „Gemmatimonadetes“. National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Undef&id=142182&lvl=6&srchmode=1&keep=1&unlock. посет. 20 март 2016 г. 
  9. „16S rRNA-based LTP release 123 (full tree)“. Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. http://www.arb-silva.de/fileadmin/silva_databases/living_tree/LTP_release_123/LTPs123_SSU_tree.pdf. посет. 20 март 2016 г. 

Надворешни линкови[уреди | уреди извор]

  • Brief taxonomy
  • Fawaz, М. N. (2013). Revealing the Ecological Role of Gemmatimonadetes Through Cultivation and Molecular Analysis of Agricultural Soils. 44-60. Brief review of the phylum.